合肥院全面實施“人才強企”戰略，在控制人員總量的前提下，以提高員工素質為主導，優化企業的人力資源配置，盤活現有人力資源。實現人力資源“規模適當、結構合理、機制創新、素質優良、管理規范、環境優化”的目標。即人力資源供給與企業發展需求基本適應，人力資源配置科學、用人機制合理和分配機制科學靈活，績效管理取得成效，員工激勵與培訓開發有效結合充分，提高員工整體素質，現代人力資源管理理念基本確立，人才成長的環境進一步優化，人力資源開發與管理步入良性發展軌道。努力吸引和培養高素質的經營、管理、技術、營銷和具有綜合素質的各類復合型人才，營造良好的用人機制，合理調整人力資源結構，建立和完善薪酬管理體系和績效管理體系，充分調動員工的積極性和創造性。 

合肥院（包括分子公司）現有職工1120人，其中享受政府特殊津貼人員7人，擁有教授級高級工程師124人，高級工程師169人，工程師295人，博士后1人，博士4人，碩士130人，本科學歷以上人員占總人數51%以上。